故事发生在明嘉靖年间。平安镖局遭受了多年不遇的“走麦城”，押镖的一干人马在关外遭番兵掳劫，王兆兴（吴奇隆 饰）和谷平安（王鸥 饰）觉事情蹊跷，决定查明真相。在好友高翔（皇轩 饰）协助下，终于查明劫镖的是镇守边关的腾飞将军（海波 饰），这期间腾飞差人捕获了王兆兴，并嫁祸于他，谷平安联络众捕头，决定在行刑之日劫法场。不料行刑当日寡不敌众，谷平安等人被腾飞的军队制服。围观的老百姓早就对欺压百姓的腾飞军队恨之入骨，奋起与军队抗衡，众人合力将腾飞就地正法。死后的腾飞被朝廷追封，谷平安心中不服，但王兆兴的一番话让他顿然醒悟......

盐帮势力扩张过猛，朝廷决定进行打压，车千户派出五人小组实施抓捕盐帮首领的计谋。而此时，盐帮副帮主万千里却暗地里杀死了帮主万廷玉，盐帮一时乱作一团。原来万千里是想借眼帮大会之际升任盐帮帮主，恰好谷平安也将盐帮圣物石尊押镖给盐帮长老，万千里高兴不已，却不料五人小组已做好缜密部署，万千里被及时抓获。可狡猾的万千里却利用丐帮传播消息救他，同时在五人小组内部进行策反，由于万千里的捣鬼，王兆兴被认为是叛徒，不想五人之一的长者却是反水者，长者顶着万千里的重金承诺，将其护送到荣州，王兆兴等人也历尽艰险，追随到荣州。最终众人万万没想到万千里拿着石尊竟然是要打开盐帮的宝库。然而万千里的美梦能成真吗？长者遗恨自己一个老龙骑禁军竟不如王兆兴这个新丁。可悲可叹啊！

明嘉靖年间，东瀛倭寇犯我疆土，百姓深受其害，平安镖局也卷入其中。倭寇大举侵略东辽，大明使臣安公朴（李华 饰）自朝鲜返回途中遭遇倭寇至今下落不明，千户大人令锦衣卫王兆兴（吴奇隆 饰）找到安公朴，护送至辽中千户营。找到安公朴后，一干人马奔辽阳而去，但脱险后的安公朴视沿途百姓求救声而不见，只顾自身逃命。平安镖局副总镖头谷平安（王鸥 饰）不堪目睹百姓沦亡，自愿免费护送百姓去辽阳。途中遭日本忍者追杀，谷平安和王兆兴以民族大义为重，摒弃前嫌联手与倭寇拼杀。倭寇的穷追不舍令王兆兴生疑，他逼安公朴说出此行的真相，被逼无奈的安公朴终于吐露了内心的秘密......

王兆兴已和谷平安过上了甜美安逸的日子，但突然王兆兴收到了龙骑禁军的召唤。为救义父“车千户”，王兆兴又拿起了大枪重新加入锦衣卫。没想到在执行任务过程中龙骑禁军全军覆没，只留下王兆兴一人逃出虎口。更令人意想不到的是王兆兴回到家中，却发现……

王兆兴从小一起长大的师妹在上次任务中牺牲，令王兆兴萌生去意，在京城中欲向车千户辞职，车千户令其站好最后一斑岗，押送一名投诚叛将到兵部。一桩看似简单的任务但危机四伏，在紧要关头谷平安等人赶来相助，终于完成了“终极任务”，而王兆兴的命运又如何呢？　　大明朝锦衣卫飞鱼营校尉王兆兴的师妹晶晶在执行任务时牺牲。晶晶临死之前，奉劝王兆兴离开飞鱼营，原因是飞鱼营内部有问题。师妹没说完飞鱼营组织内部到底出了什么问题就咽了气，留给王兆兴无尽的痛苦和疑惑。带着师妹留下的疑惑和对平安镖局副总镖头谷平安的承诺，王兆兴启程赶赴京城，求见义父车千户大人。 飞鱼营是大明朝皇家卫队中最秘密、也是最值得托付的精英组织，内部有着严明的纪律和组织结构，擅自离开飞鱼营者将受到军法的处置。尽管如此，王兆兴仍然历数自己进入飞鱼营以来的建树和苦衷，最终征得义父的同意，但前提是要完成义父交代的最后一项任务，于天黑之前押送番军一名投降将军至兵部受审。　　王兆兴于德胜门外从边防军将士手里接过押送番军投降将军穆天有的任务，几招驯服桀骜不羁的穆天有，将穆天有装扮成中原人士模样，按指定路线向兵部而去。在一酒肆门前，接连两拨黑衣杀手直奔穆天有而来，还口口声声劝飞鱼营校尉王兆兴少管闲事。王兆兴联手穆天有，击退黑衣杀手，同时查明此行系青蛇会所为。　　青蛇会在江湖中人称“索命帮”，青蛇会怎么知道王兆兴的身份，以及王兆兴押送番军投降将军的路线？王兆兴决定全力完成这次终极任务，同时查明真相。与此同时，义父车千户大人为王兆兴离开飞鱼营上下奔走，平安镖局副总镖头谷平安牵挂王兆兴的安危，带着手下两个得力助手大牛和小马向京城赶来。　　京城里，通往兵部的路上杀机四伏，已经与王兆兴形同朋友的穆天有无事生非，闯进春满楼妓院要给曾经的红颜知己赎身。穆天有在春满楼陷入锦衣卫校尉吴大海的围困之中，如果不是王兆兴及时赶到，穆天有的性命堪忧。原来，在穆天有押送兵部受审之前，设法要穆天有性命的正是吴大海，因为穆天有的受审，将危及到朝廷的几位高官。　　王兆兴带着穆天有杀出重围，在及时赶到京城的谷平安的帮助下暂时脱离困境。谷平安将王兆兴和穆天有带到谭家酒坊商量对策，与锦衣卫结怨甚深的顺天府朱捕头横插进来，亲自护送王兆兴前往兵部。兵部门口，王兆兴一行击退吴大海，将穆天有平安送进兵部，揪出朝廷数名私通番邦的贪官。王兆兴离开飞鱼营，与谷平安结为百年之好。