2050年，流行病肆虐全球，兩名偵探正著手調查一連串邪門的謀殺案，是惡魔所為的謠言四起，但真正有關的居然是...神秘忍者！

当年在努布拉岛营建侏罗纪公园时，约翰•哈蒙德（理查德•阿滕伯勒RichardAttenborough饰）曾把附近的索纳岛作为恐龙的制造工场。侏罗纪公园沦陷后，索纳岛上的恐龙在完全隔绝且缺少必要合成元素的情况下生存了4年时间。哈蒙德对此颇感好奇，他重新找到马科姆博士（杰夫•高布伦JeffGoldblum饰），邀请他前往小岛考察。4年前经历让马科姆心有余悸，他断然拒绝哈蒙德的提议，但当得知女友莎拉（朱丽安•摩尔JulianneMoore饰）已前往小岛之时，只得跟随探险队整装出发。